Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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