Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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HMGN3Q15651 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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HMGN3Q15651 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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