Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC009248.1-201ENST00000548155 735 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AP001554.1-201ENST00000604533 376 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RN7SL760P-201ENST00000607344 270 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AL451054.3-201ENST00000611115 776 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RPL36AP21-202ENST00000639134 430 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 GAGE12E-201ENST00000381698 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 TRBV6-1-201ENST00000390353 401 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 CELSR3-AS1-201ENST00000421275 196 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC004160.2-201ENST00000425837 563 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 NQO1-204ENST00000439109 924 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 RPS20P23-201ENST00000461683 354 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC022730.2-201ENST00000465359 452 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 RN7SL368P-201ENST00000473384 277 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 OR7E85P-201ENST00000512164 985 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 NUTF2P2-201ENST00000551207 384 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 NDUFA3P1-201ENST00000588007 252 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AL021808.1-201ENST00000604325 1117 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC116165.3-201ENST00000614524 400 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AP000590.1-201ENST00000624943 464 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms