Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
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