Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms