Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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