Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
ZNF56Q15929 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
ZNF56Q15929 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF56Q15929 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF56Q15929 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF56Q15929 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF56Q15929 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF56Q15929 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF56Q15929 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF56Q15929 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF56Q15929 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF56Q15929 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF56Q15929 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF56Q15929 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF56Q15929 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF56Q15929 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF56Q15929 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF56Q15929 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF56Q15929 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF56Q15929 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF56Q15929 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF56Q15929 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF56Q15929 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF56Q15929 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF56Q15929 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF56Q15929 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF56Q15929 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF56Q15929 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF56Q15929 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF56Q15929 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF56Q15929 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF56Q15929 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF56Q15929 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms