Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms