Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
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PTPRMP28827 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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