Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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ATG3Q9NT62 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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ATG3Q9NT62 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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ATG3Q9NT62 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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ATG3Q9NT62 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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ATG3Q9NT62 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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ATG3Q9NT62 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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