Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms