Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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