Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNAPC1Q16533 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNAPC1Q16533 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNAPC1Q16533 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNAPC1Q16533 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNAPC1Q16533 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNAPC1Q16533 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNAPC1Q16533 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNAPC1Q16533 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SNAPC1Q16533 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SNAPC1Q16533 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
SNAPC1Q16533 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SNAPC1Q16533 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
SNAPC1Q16533 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
SNAPC1Q16533 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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