Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.6 ms