Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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SMC1AQ14683 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
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SMC1AQ14683 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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