Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.3 ms