Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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CCINQ13939 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCINQ13939 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCINQ13939 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCINQ13939 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCINQ13939 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCINQ13939 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCINQ13939 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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CCINQ13939 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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CCINQ13939 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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CCINQ13939 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCINQ13939 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCINQ13939 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCINQ13939 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCINQ13939 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CCINQ13939 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
CCINQ13939 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CCINQ13939 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CCINQ13939 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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