Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
APOFQ13790 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
APOFQ13790 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
APOFQ13790 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
APOFQ13790 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
APOFQ13790 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
APOFQ13790 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
APOFQ13790 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
APOFQ13790 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
APOFQ13790 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
APOFQ13790 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
APOFQ13790 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
APOFQ13790 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
APOFQ13790 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
APOFQ13790 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.1 ms