Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
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PTPN13Q12923 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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PTPN13Q12923 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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PTPN13Q12923 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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