Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UPP1Q16831 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
UPP1Q16831 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
UPP1Q16831 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
UPP1Q16831 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
UPP1Q16831 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
UPP1Q16831 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
UPP1Q16831 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms