Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
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