Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC93Q567U6 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms