Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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SMCO1Q147U7 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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