Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms