Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gm17190V9GX38 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm17190V9GX38 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm17190V9GX38 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm17190V9GX38 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm17190V9GX38 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm17190V9GX38 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm17190V9GX38 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm17190V9GX38 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm17190V9GX38 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm17190V9GX38 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm17190V9GX38 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Gm17190V9GX38 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm17190V9GX38 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17190V9GX38 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17190V9GX38 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17190V9GX38 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17190V9GX38 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm17190V9GX38 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17190V9GX38 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17190V9GX38 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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