Protein–RNA interactions for Protein: S4R1W1

Gm3839, Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3839S4R1W1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms