Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Hdac6Q9Z2V5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdac6Q9Z2V5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Hdac6Q9Z2V5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Hdac6Q9Z2V5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Hdac6Q9Z2V5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Hdac6Q9Z2V5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Hdac6Q9Z2V5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Hdac6Q9Z2V5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdac6Q9Z2V5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Hdac6Q9Z2V5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
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