Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms