Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms