Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd3Q9Z2D8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms