Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms