Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms