Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ilf3Q9Z1X4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ilf3Q9Z1X4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ilf3Q9Z1X4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ilf3Q9Z1X4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ilf3Q9Z1X4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ilf3Q9Z1X4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ilf3Q9Z1X4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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