Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X0

Ccl27, C-C motif chemokine 27, mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl27Q9Z1X0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl27Q9Z1X0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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