Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms