Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms