Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup160Q9Z0W3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms