Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L3

Oc90, Otoconin-90, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oc90Q9Z0L3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Oc90Q9Z0L3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Oc90Q9Z0L3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Oc90Q9Z0L3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Oc90Q9Z0L3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Oc90Q9Z0L3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Oc90Q9Z0L3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Oc90Q9Z0L3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Oc90Q9Z0L3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Oc90Q9Z0L3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Oc90Q9Z0L3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Oc90Q9Z0L3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Oc90Q9Z0L3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Oc90Q9Z0L3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Oc90Q9Z0L3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Oc90Q9Z0L3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Oc90Q9Z0L3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Oc90Q9Z0L3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Oc90Q9Z0L3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Oc90Q9Z0L3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Oc90Q9Z0L3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Oc90Q9Z0L3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms