Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms