Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme3Q9WV85 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms