Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms