Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms