Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms