Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpv2Q9WTR1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms