Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms