Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTN0

Ggps1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1Q9WTN0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ggps1Q9WTN0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggps1Q9WTN0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms