Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms