Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Y5

Hic1, Hypermethylated in cancer 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hic1Q9R1Y5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hic1Q9R1Y5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hic1Q9R1Y5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms