Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms