Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ntn3Q9R1A3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ntn3Q9R1A3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ntn3Q9R1A3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ntn3Q9R1A3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ntn3Q9R1A3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ntn3Q9R1A3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ntn3Q9R1A3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ntn3Q9R1A3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ntn3Q9R1A3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ntn3Q9R1A3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ntn3Q9R1A3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ntn3Q9R1A3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ntn3Q9R1A3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ntn3Q9R1A3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ntn3Q9R1A3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ntn3Q9R1A3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ntn3Q9R1A3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ntn3Q9R1A3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ntn3Q9R1A3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ntn3Q9R1A3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ntn3Q9R1A3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ntn3Q9R1A3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms